菜单栏位于标题栏下方，包含 文件、编辑、视图、对象、结构、帮助 六个核心菜单，集中了软件的全部功能入口。用户可通过菜单栏快速访问文件管理、结构编辑、界面设置及帮助等功能。
ChemDraft 菜单栏包含以下功能菜单：
| 菜单 | 功能说明 |
|---|---|
| 文件 | 提供新建、打开、保存、导出等文件管理功能。 |
| 编辑 | 提供撤销、重做、复制、粘贴等常用编辑功能。 |
| 视图 | 提供界面布局及显示方式的调整功能。 |
| 对象 | 提供对象编辑及属性管理功能。 |
| 结构 | 提供化学结构绘制、处理及分析等相关功能。 |
| 帮助 | 提供帮助文档、版本信息及意见反馈等功能。 |