ChemDraft 支持为结构中的碳原子自动生成编号，便于结构分析、文献标注及实验交流。生成的编号可独立调整位置，并能够随结构颜色自动匹配，提高结构图的可读性。
显示与隐藏编号
选中需要编号的结构后，可通过浮动工具栏「更多」→「碳原子编号」开启碳原子编号功能。开启后，菜单项前方会显示“✓”标记，表示当前结构已显示碳原子编号；再次执行该命令，可隐藏所有碳原子编号。
该功能仅控制碳原子编号的显示状态，不影响分子的结构、连接关系及化学属性。
调整编号位置
生成的碳原子编号可使用「选择工具」进行框选，并拖拽至合适位置，以避免与结构、文字或其他标记重叠，提高结构图的可读性。
编号更新规则
碳原子编号会随结构变化自动更新。
当删除化学键导致结构发生变化时，软件会重新计算并调整碳原子编号；删除结构中的元素符号，则不会影响已有碳原子编号的排列顺序。
编号颜色
当结构中的原子或化学键设置为其他颜色时，新生成的碳原子编号会自动继承对应结构的颜色，使编号与结构保持一致的配色效果。
